Protac（蛋白质降解靶向嵌合分子）的鉴定是一个关键的步骤，用于确认其对目标蛋白质的选择性和有效性。以下是一些常用的Protac鉴定方法：

细胞系实验：通过在细胞系中表达目标蛋白质和评估Protac对其降解的影响来验证Protac的活性。这可以通过Western blot或其他蛋白质检测方法来检测目标蛋白质的水平变化来实现。

荧光标记：将Protac或目标蛋白质标记为荧光标记物，以便跟踪它们在细胞内的位置和相互作用。

蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）实验：使用技术如蛋白质共沉淀或双向免疫沉淀来验证Protac是否能够促使目标蛋白质与E3连接酶结合。

蛋白质稳定性分析：通过测量目标蛋白质的半衰期来评估Protac对其稳定性的影响，因为降解的蛋白质通常具有较短的半衰期。

转录水平分析：通过实时荧光定量PCR（qPCR）等技术检测目标蛋白质的mRNA水平，以确定Protac是否影响其转录。

蛋白质合成抑制实验：通过添加蛋白质合成抑制剂（如环丙沙星）来验证Protac引起的蛋白质降解是否依赖于新蛋白质合成。

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