该结合物在神经科学与药理学研究中具有重要应用。例如，利用其荧光特性，可通过活细胞成像技术实时追踪内啡肽在神经元或外周组织中的分布与动态变化，为揭示其作用机制提供直观证据。此外，罗丹明B-Endorphin还可用于开发高灵敏度的检测方法，如荧光免疫分析，以定量测定生物样品中内啡肽的含量，为研究疼痛、成瘾或抑郁症等相关疾病提供工具支持。
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