Cy3.5-马来酰亚胺的水阴离子型较低，因而在水相的符号反應工作机制内应该食用共高沸点萃取剂，常常用高沸点萃取剂还有DMF，DMSO和乙腈等。如需符号的原子对高沸点萃取剂，自选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化Cy3.5-马来酰亚胺()。三者的光谱分析类型基本上保持一致，因而大一部分适用可互为截取。三者的最主要辨别而言：磺化染剂是水阴离子型的，在水相的符号反應工作机制内不应该食用共高沸点萃取剂，从而消减染剂在河中聚在一起的也许性，减弱符号吸收率。Cy3.5-马来酰亚胺标记符号后的乙酰乙酸Ex/Em是591nm/604nm。和它更具类似荧光显著特点的活性染料以及Texas Red®，Alexa Fluor 594, BODIPY® TR, DyLight 594等。

注意事项

• Cy3.5-马来酰亚胺水无水磷酸氢较低，标识生理反应可在可挥发萃取剂中确定亦或含可挥发助萃取剂的水相中确定。
• 生物制品分子结构中巯基一般来说于空气氧化环境(如双硫键)存在的，在马来酰亚胺标示前，务须用恢复备份剂(如DTT，TCEP)碱化巯基并删去太多恢复备份剂。
• 马来酰亚胺也可不可以和叠氮类化合物现象，应以免 叠氮官能团。
• 标志体现无需放置于阳光下，如果大区域荧光氧化物在阳光下长期限作用会慢慢的光孤单(photobleaching)。

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